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    Étude microbiologique, épidémiologique et antibiorésistance du Staphylococcus aureus dans le lait de vache atteinte de mammite.
    (2017-01-11) BELMAMOUN AHMED REDA; Encadreur: BEREKSI REGUIG Karima
    Résumé (Français et/ou Anglais) : En Algérie, le lait est consommé le plus souvent à l’état cru échappant ainsi à tout contrôle de qualité. La mammite est devenue un problème de sécurité alimentaire par sa forme subclinique de la maladie. Notre hypothèse dans cette étude est que la consommation du lait cru des vaches avec des mammites subcliniques est un outil de transmission de staphylocoques résistants aux antibiotiques, pouvant passer inaperçus vers l’homme. Un total de 981 échantillons de lait cru ont été obtenus à partir des quartiers de 250 vaches laitières. Le test de la mammite Californie (CMT) a été effectué pour diagnostiquer la présence de la mammite subclinique. Les échantillons de lait ont été l’objet d’une étude bactériologique et les colonies présumées ont été confirmées en premier lieu phénotypiquement par la caractérisation biochimique utilisant le système API-20-Staph. La détermination de certains facteurs de virulence pour les staphylocoques a été réalisée en combinaison entre la production de la coagulase libre (la méthode en tube) et liée (le test du Staphytect plus) pour l’identification des isolats et, la production de la Dnase. Les tests de sensibilité ont été réalisés par la méthode de diffusion sur gélose Muller-Hinton pour 13 antibiotiques fréquemment utilisés en médecine vétérinaire en Algérie et, le système VITEK 2 est utilisé pour la détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) pour les souches confirmées comme S.aureus. Dans la deuxième partie de notre étude, une caractérisation génotypique des facteurs de virulence, par la détection de la présence du gène coa et du gène nuc chez les souches de S.aureus isolées par amplification par PCR. Des facteurs de risque hypothétiques affectant la mammite subclinique ont été étudiés comme la race, la saison, l’âge, le vêlage ; ces derniers impliquent une interaction claire entre l’hôte et l’agent causal., Selon le CMT, la prévalence de la mammite subclinique dans la région est de 33,6%. L'examen bactériologique a révélé un pourcentage d'échantillons positifs de 14,2%. Dans l'ensemble, il y avait une association positive significative entre l'examen bactériologique et le CMT dans le lait obtenu par le Test Khi 2 (p<0,001). L'identification biochimique a montré que 73,75% des isolats sont des Staphylocoques à coagulase négatif et, que 26,25% sont des S.aureus. Après l’identification biochimique le test de Staphytect plus et le test de la coagulase en tube ont été réalisés. Une réaction significativement positive (p<0,001) a été établie pour les souches de S.aureus ; sur 21 souches identifiées 19 (90,48%) souches se sont révélés positives. Des souches non S.aureus considérées normalement comme des coagulases négatives se sont avérées des coagulases positives : S. xylosus, S. hominis , S. caprae , S. intermidius , S. chromogenes , S. sciuri , S. epidermis , S. lentus , S. hyicus . Dans la présente étude, l'activité Dnase était positive chez 23.75% et 33.75% pour S.aureus et Staphylocoque coagulase négatifs (SCN), respectivement. Sur le total de 21 isolats de S. aureus, 19 (90.48%) isolats ont été trouvés Dnase positifs et 2(9.52%) Dnase négatifs. La résistance à la pénicilline G touche 61,02 % des souches de SCN, celle à la tétracycline est de 74,58 %. Pour S. aureus, nous avons retrouvé une résistance élevée à la pénicilline G 80,95% et à la tétracycline 71,43%. Selon nos résultats, 02 (9.52%) isolats de S. aureus sont résistants à la meticilline, avec modification de Protéines liant les pénicillines (PLP), identifié par le test du disque de l’oxacilline avec un diamètre de : R ≤10 mm et confirmé par une CMI ≥4µg/l. La MIC de la vancomycine a prouvé que 01 souche est une VRSA avec une MIC ≥32µg/ml, et 01 seconde souche est une hétéro-VISA avec un MIC ˃1µg/ml. Nous avons noté que pour les 21 souches de S.aureus, 11 phénotypes de résistances différents dominées par la résistance à la pénicilline G. L’amplification par PCR de l'extrémité 3 'du gène coa des isolats de S. aureus, a révélé que parmi 21 isolats, 18 d’entre eux donnent une seule bande comprise entre 547 pb et 875 pb. Dans la présente étude, les amorces utilisées pour le gène nuc ont reconnu 19 isolats de S. aureus parmi les 21 isolats, et la taille moléculaire du produit d’amplification du gène nuc est de 395pb. L'analyse du chi carré (X2) a révélé qu'il y avait une dépendance entre le test CMT et la race (P=0,026), avec une prévalence de la mammite subclinique aux niveaux des quartiers chez 204 (30,72%) vaches croisées. Le groupe d'âge de 1-4 ans était le plus sensible à la mammite subclinique. Dans la présente étude, il existe une dépendance entre la survenue de la mammite subclinique, le stade de lactation (p<0,001), le vêlage (p=0,041) chez les vaches de race croisées, et la zone de prélèvement (p=0,043). Le résultat de la bactériologie dépend du stade de lactation, de la race et de la saison avec des p de (0,031, 0,017, 0,005) respectivement. Nos résultats indiquent que la vache est loin d’être atteinte d’une mammite subclinique au milieu du stade de lactation (OR=0,357, p<0,001 et IC=95%). Nos résultats ont indiqué qu’il y’a un passage des staphylocoques multi-résistants dans le lait cru consommé dans la région ouest de l’Algérie, avec une prévalence supérieure des staphylocoques coagulase négatifs par rapport aux S. aureus. Malgré le pouvoir pathogène méconnu de certaines espèces, ces organismes peuvent être des réservoirs de résistance aux antibiotiques ; ce qui nécessite une surveillance périodique de la résistance des staphylocoques aux antimicrobiens dans le but de contrôler leurs propagations.
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    Influence du niveau de la complémentation énergétique sur les performances de croissance et sur l’activité sexuelle chez les agneaux de race Ouled Djellal depuis le sevrage jusqu’à la puberté
    (2018-10-24) ZINEDDINE ESMA; Encadreur: BEREKSI REGUIG Karima
    الملخص(بالعربية) أجريت دراستنا على 20 حمل من أولاد جلال، تتراوح أعمارهم بين 3 إلى 4 أشهر (102 ± 12 يومًا) وترعرعت في مزرعة التظاهرة التابعة ل I.T.ELV Lamtar de Sidi-Bel-Abbès. الهدف الرئيسي هو تقييم تأثير مستوى الغذاء على البارامترات morphobiometric ، وهي الوزن ، والنمو الإحصائي والنمو الخصوي في ولادة Ouled Djellal ، التي يتم تربيتها لاستبدالها كمربيات المستقبل من الفطام إلى فترة البلوغ. أثناء دراسة التمثيل الغذائي والهرمونات من هذه الحملان طوال فترة الاختبار. يتم وزن هذه الحملان المفطومة وتقسم إلى قطعتين على أساس الوزن. ثم تتلقى هذه المجموعات وجبتين غذائيتين على مستوى مختلف لمدة ستة أشهر من مارس إلى أغسطس 2015. يتلقى القسم الأكبر من العلف أعلاما مركزة على الحبوب، بمعدل 400 غرام في اليوم ولكل حيوان، بالإضافة إلى الرعي، في حين يتلقى اللوط الكثير 200 جرام فقط من نفس العلف المكمل. تم إجراء القياسات الشهرية لوزن الجسم وحجم الخصية والارتفاع عند الكبريت ومستوى السكر في الدم والكولسترول والبروتين والمصل ومستويات التستوستيرون طوال فترة الدراسة.تم إثبات تقييم السلوك الجنسي للهوائيات باستخدام النعاج البالغة التي يتم فيها تحفيز الإسترخاء بشكل مصطنع من خلال CIDR من يونيو 2015 حتى نهاية التجربة.يتم قياس الثوابت البيولوجية بالطيف الضوئي. يتم تحقيق جرعة التستوستيرون عن طريق الإشعاع الكيميائي. يتم إجراء تحليل البيانات باستخدام برنامج StatView (الإصدار 5، 1998 SAS Institute Inc. France).تظهر النتائج التي توصلنا إليها التأثير الكبير للنظام الغذائي على أداء morphobiometric من الحملان من ارتفاع الكثير مقارنة مع تلك التي تغذت على نظام غذائي منخفض وهي وزن الجسم (p <0.0001)، حجم الخصية (p <0.0001) في حين كان الارتفاع عند الارتفاعات مرتفعًا بشكل ملحوظ لصالح الحملان المنخفضة (p=0.04).مستويات الجلوكوز في الدم في كل من الحملان العالية والمنخفضة (0.70 ± 0.12 مقابل 0.67 ± 0.13 جم / لترp=0.08,) مرتفعة نسبياً. إجمالي كوليستيرول الدم في الحملان في القفزات العالية والمنخفضة (0.52 ± 0.15 مقابل 0.42 ± 0.16 جرام / لتر p<0.0001,)، ومستويات البروتين الكلي في الدم في الحملان في القفزات العالية والمنخفضة (50.54 ± 10.60 مقابل 42.60 ± 10.33 جم / لتر p<0.0001,) وإجمالي مستويات الضأن في العقود المرتفعة والمنخفضة (81.35 ± 15.84 مقابل 74.21 ± 15.92 ملغم / لتر) أقل بكثير. من ناحية أخرى، فإن إجمالي هرمون التستوستيرون في الحملان في العلاوة العالية والمنخفضة (0.65.0.43 مقابل 0.58 ± 0.44 نانوغرام / مل p=0.16, ) هو في المعايير نسبيا ويرتبط ارتباطًا وثيقًا بالعمر (r = 0.77 مقابل r = 0.75)، مع حجم الخصية (r = 0.74 مقابل r = 0.75) والوزن الحي (r = 0.74 مقابل r = 0.75). في عمر 8.60 ± 0.39 شهرًا، أعربت الهوائيات من الدفعة العالية عن سلوكها الجنسي مع الجماع الكامل في حين أن تلك الدُفعة منخفضة حصلت على هرمون تستوستيرون قدره 1.32 ± 0.42 نانوغرام / مل، لكن التعبير عن نشاطها التكاثري قليل تأخر مع تعويض من 15.8 ± 6.01 يوما، أي حوالي سن 8.15 ± 0.24 شهرا.يظهر تحليل التباين أن الثوابت البيولوجية تتأثر بشكل كبير بمستوى مكملات الطاقة لبعض معايير الكيمياء الحيوية في الدم، وهي كوليستيرول الدم (p<0.001)، البروتين الكلي (p<0.0001) ومصل الكالسيوم (p = 0. 01) دون أن يكون لها تأثير معنوي على مستوى الجلوكوز في الدم (p = 0.17). وفي الختام، فإن أداء النمو في أولاد جلال يولد الخروف، كما أن البارامترات البيوكيميائية الأيضية والإندروجينية تتأثر بمقاييس مختلفة عن طريق مكملات الطاقة عالية المستوى. وقد حسّن هذا الأخير نمو أداء الحملان من الفطام إلى بداية البلوغ مع زيادة جودة التعبير عن السلوك الجنسي لمربي المستقبل Résumé (Français et/ou Anglais) : Notre étude a été menée sur 20 agneaux de race Ouled Djellal, âgés de 3 à 4 mois (102 ± 12 jours) et élevés au niveau de la ferme de démonstration de l’I.T.ELV Lamtar de Sidi-Bel-Abbès. L’objectif principal est d’évaluer l’effet du niveau alimentaire sur les paramètres morphobiométriques à savoir la croissance pondérale, staturale et testiculaire chez les agneaux de race Ouled Djellal destinés au remplacement comme futurs reproducteurs depuis le sevrage jusqu’à la période de puberté tout en étudiant le profil métabolique et hormonal de ces agneaux durant toute la période d’essai. Ces agneaux sevrés sont pesés et répartis en deux lots sur base du poids. Ces groupes reçoivent ensuite deux régimes alimentaires à un niveau différent durant six mois à partir de Mars à Août 2015. Le lot Haut reçoit un aliment concentré composé à base de céréales, à raison de 400 g par jour et par animal, en plus du pâturage alors que le lot Bas ne reçoit que 200 g du même aliment en supplémentation. Mensuellement, les mesures des poids vif, volume testiculaire, hauteur au garrot et les dosages de glycémie, cholestérolémie, protéinémie, calcémie et testostéronémie ont été établies pendant toute la période de l’étude. L’évaluation du comportement sexuel des antenais a été mise en évidence en utilisant des brebis adultes chez lesquelles l’oestrus est induit artificiellement par le biais du CIDR à partir du mois de Juin 2015 jusqu’à la fin de l’essai. Les constantes biologiques sont mesurées par spectrophotométrie. Le dosage de la testostérone est réalisé par chimiluminescence. L’analyse des données est effectué à l’aide du logiciel StatView (version 5, 1998 SAS Institute Inc. France). Nos résultats montrent l’effet significatif du régime alimentaire sur les performances morphobiométriques à savoir la croissance pondérale (p<0.0001), le développement testiculaire (p<0.0001) en faveur des agneaux du lot Haut et à moindre degré sur l’évolution staturale (p=0.04) au bénéfice des animaux du lot Bas. La glycémie chez les agneaux des deux lots Haut et Bas (0.70±0.12 vs 0.67±0.13 g/L, p=0.08) est relativement élevée. La cholestérolémie totale des agneaux des lots Haut et Bas (0.52±0.15 vs 0.42±0.16 g/L, p<0.0001), les taux sériques des protéines totales des agneaux des lots Haut et Bas (50.54±10.60 vs 42.60±10.33 g/L, p<0.0001) et la calcémie totale des agneaux des lots Haut et Bas (81.35±15.84 vs 74.21±15.92 mg/L, p=0.004) sont significativement basses. En revanche, La testostéronémie totale des agneaux du lot Haut et Bas (0.65.0.43 vs 0.58±0.44 ng/ml, p=0.16) est relativement dans les normes et elle est fortement corrélés à l’âge (r= 0.77 vs r=0.75), au volume testiculaire (r= 0.74 vs r=0.75) et au poids vif (r= 0.74 vs r=0.75). A l’âge de 8.60±0.39 mois, les antenais du lot Haut ont exprimé leur comportement sexuel avec coït complet alors que ceux du lot Bas ont obtenu une testostéronémie de 1.32±0.42 ng/ml mais l’expression de leur activité copulatoire est légèrement retardée avec un décalage de 15.8±6.01 jours soit vers l’âge de 8.15±0.24 mois. L’analyse de la variance montre que les constantes biologiques sont influencées significativement par le niveau de la complémentation énergétique concernant certains paramètres biochimiques sanguins à savoir la cholestérolémie (p<0.001), la protéinémie totale (p<0.0001) et la calcémie (p=0.01) sans avoir d’effet significatif sur la glycémie (p=0.17). Toutefois, on note l’absence d’effet significatif du niveau de l’alimentation sur la testostéronémie chez les animaux du groupe Haut et Bas (p=0.41). En conclusion, les performances de croissance des agneaux de race Ouled Djellal et les paramètres biochimiques métaboliques et androgénique semblent influencés à différentes échelles par la complémentation énergétique de haut niveau. Cette dernière a amélioré les performances de croissance des agneaux depuis le sevrage jusqu’à l’apparition de la puberté tout en augmentant lègerement la qualité de l’expression du comportement sexuel des futurs reproducteurs.