Étude de l’activité antifongique des souches d’Actinomycètes isolés à partir des sols sahariens
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Date
2020
Authors
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Abstract
Résumé : ( Français )
Cette étude concerne l’isolement, la taxonomie et les antibiotiques antifongiques des Actinomycètes d’origine saharienne. Pour cela, 85 isolats devraient être collectés à partir de 14 échantillons de sols sahariens, et devraient faire l’objet d’une étude préliminaire de classification sur la base de leur morphologie, et également d’une évaluation de leurs propriétés antifongiques.
Les meilleurs isolats devraient être retenus pour des études plus approfondies. L’étude taxonomique basée sur les caractéristiques culturales, micro morphologiques et chimiques (analyse des constituants cellulaires en acides aminés, en sucres et en phospholipides) devrait permettre de rattacher les isolats au genre Streptomyces. Sur la base des analyses physiologiques, et surtout moléculaires (PCR et séquençage de l’ADN ribosomique 16S, phylogénie), la meilleure souche antagoniste devrait être rapprochée de l’espèce Streptomyces mutabilis.
Un de ces isolats devrait être sélectionné sur la base de leur propriété antagoniste intéressante, particulièrement vis-à-vis de champignons filamenteux pathogènes. Des cinétiques de production des antibiotiques en milieux ISP2 et Bennett liquides devraient être montrés la présence de plusieurs maximas suggérant la sécrétion de plusieurs composés bioactifs.
La purification par HPLC devrait montrer que la souche se compose d’un seul antibiotique.
Les études spectroscopiques (UV-visible et spectrométrie de masse) devraient montrer que l’antifongique est de nature non polyénique et devrait être relativement stable vis-à-vis du pH, de la température et de la lumière.
Mots clés: sols sahariens, actinomycètes, Streptomyces, taxonomie, propriétés antagonistes,
antibiotiques.
Abstract : ( Anglais )
The goals of this study are the isolation, the taxonomy of Saharan Actinomycetes, and the study of the antifungal compounds produced by these Actinomycetes. For that, 85 isolates should be collected from 14 different samples of Saharan soils, and should be the subject of a preliminary classification study based on morphology, and an evaluation of their antifungal properties.
The best isolates should be retained for further study. The taxonomic study based on cultural, micro-morphological and chemical characteristics (analysis of cellular constituents of amino acids, sugars and phospholipids) showed that the best antagonistic strain should be related to Streptomyces. The best antagonist strain should be related to the species Streptomyces mutabilis, because of the physiological and especially molecular analyses (PCR and sequencing of ribosomal DNA 16S, phylogeny). One of these isolates should be selected, based on their interesting
antagonistic properties, particularly vis-à-vis the filamentous pathogenic fungi. The kinetics of antibiotic should be realized in liquid media ISP2 and Bennett should be shown the presence of several maxima of antifungal activity, indicating the production of several antibiotic complexes.
The purification by HPLC should show that the strain composed of only one antibiotic. Spectroscopic studies (UV-visible and mass spectrometry) should show that the antifungal is non-polyenic in nature and should be relatively stable with respect to pH, temperature and light.
Keywords: Saharan soils, Actinomycetes, Streptomyces, taxonomy, antagonistic properties, antibiotics.
Description
Mémoire master 2 biologie
