Contribution à l’évaluation de la formation de biofilm des souches bactérienne isolées de la peau lésée chez les diabétiques

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2021
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Résumé : ( Français ) Les infections du pied diabétique sont un problème majeur lié au diabète dans le monde en raison de la forte prévalence du diabète dans la population. L'ulcération diabétique du pied représente un problème médical, social et économique mondial majeur. L’organe cutané considéré comme un écosystème microbien complexe montrant une diversité microbienne contribue de façon considérable dans la fréquence et l’évolution de cette infection chronique. Les biofilms bactériens, lors d’infections chroniques, constituent des réservoirs de pathogènes à l’origine de nombreuses infections notamment dans l’infection du pied chez les diabétiques. Le but de notre étude, est de déterminer le profil microbiologique des infections du pied diabétique, et d’analyser la distribution des isolats microbiens. Sur la base des différentes méthodes d’étude du biofilm, notre étude a été axée sur le potentiel de ces bactéries dans la contribution à la formation de biofilm. Notre étude portée sur 10 patients diabétiques, présentant des plaies infectées au niveau du pied. Cette échantillon de population, concerne la tranche d’âge [60-70] ans. La majorité de nos patients, sont de sexe masculin, soit 70% hommes, contre 30 % de femmes, et les patients ayant un diabète de type 2 représentaient 60%. A partir des prélèvements effectués nous avons isolé 10 souches bactériennes. D’autres isolats issus du pied diabétique de travaux antérieurs nous ont été octroyé par notre encadreur. Au total 23 souches ont fait l’objet de cette étude réparties en six familles. L’identification a été réalisée à l’aide de différents tests de la galerie biochimique classique et ainsi que des galeries miniaturisés API. La famille la plus dominante est celle des Corynebacteriaceae avec un taux de 26,08 %, comprenant les espèces Corynebacterium pyogènes, Corynebacterium ulcerans, et Cellulomonas spp. La seconde famille, est celle des Staphylococcaceae, avec un taux de 21,73 %, représentée par Staphylococcus aureus et les Staphylocoques à coagulase négative (SCN). La troisième famille est celle des Enterobacteriacea, avec un taux de 21.73 %, représentée par Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Enterococcus faecium, Salmonella choleraesuis, et Raoutella ornithinolytica. La quatrième famille est celle des Pseudomonadaceae, avec un taux de 8.68 %, représentée par les souches, Pseudomonas aeruginosa et Pseudomonas maltophilia. La cinquième famille est celle des Sreptococcaceae, avec un taux de 4.34 %, représentée par Streptococcus acidomonimus. La sixième famille est celle des Aerococcaceae (Ordre des Lactobacilles), avec un taux de 4.34%, représentée par Aerococcus viridans. D’autre bacilles à Gram positif, avec un taux de 13.02 % ont également été identifiés. La mise en évidence de la production de slime par des souches sur milieu RCA a révélé que 91.30 % des souches testées sont productrice de slime. La méthode TCP a révélé que 65.21 % des isolats ont un potentiel à former des biofilms : 34.78% des souches ayant présenté un pouvoir d’adhésion visible et fort sur microplaques, 30.43% des souches ont présenté un pouvoir d’adhésion modéré. Les résultats de la technique TM sont différents à ceux obtenus par la méthode TCP, il est possible de constater que 39.13 % et ont un fort potentiel d’adhésion cellulaire sur un support en verre. La recherche de la capacité d’adhésion sur lame a révélé que 73.91 % adhèrent après 3h et 91.30% après 24h d’incubation, et parfois, avec une production de slime microbiens. Pour la détermination de l’hydrophobicité des souches La totalité des souches, à l’exception de Raoutella ornithinolytica, ont présenté un pourcentage plus ou moins élevé, d’hydrophobicité, et plus à même de former des biofilms. Mot clés : Pied diabétique, Infection, Profil microbiologique, Biofilm Abstract : ( Anglais ) Diabetic foot infections are a major diabetes related problem worldwide due to the high prevalence of diabetes in the population. Diabetic foot ulceration is a major global medical, social and economic problem. The skin organ considered as a complex microbial ecosystem showing microbial diversity contributes significantly to the frequency and course of this chronic infection. Bacterial biofilms, during chronic infections, constitute reservoirs of pathogens at the origin of many infections, especially in foot infections in diabetics. The aim of our study is to determine the microbiological profile of diabetic foot infections, and to analyze the distribution of microbial isolates. Based on the different methods of studying biofilm, our study focused on the potential of these bacteria in contributing to biofilm formation. Our study focused on 10 diabetic patients with infected wounds on the foot. This sample of the population concerns the age group [60-70] years. The majority of our patients are male, i.e. 70% male, compared to 30% female, and patients with type 2 diabetes accounted for 60%. From the samples taken, we isolated 10 bacterial strains. Other isolates from diabetic foot from previous work were given to us by our supervisor. A total of 23 strains were the subject of this study divided into six families. The identification was carried out using various tests of the classical biochemical gallery and as well as the miniaturized API galleries. The most dominant family is that of Corynebacteriaceae with a rate of 26.08%, comprising the species Corynebacterium pyogenes, Corynebacterium ulcerans, and Cellulomonas spp. The second family is that of Staphylococcaceae, with a rate of 21.73%, represented by Staphylococcus aureus and coagulase negative Staphylococci (SCN). The third family is that of Enterobacteriacea, with a rate of 21.73%, represented by Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Enterococcus faecium, Salmonella choleraesuis, and Raoutella ornithinolytica. The fourth family is that of Pseudomonadaceae, with a rate of 8.68%, represented by the strains, Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas maltophilia. The fifth family is that of Sreptococcaceae, with a rate of 4.34%, represented by Streptococcus acidomonimus. The sixth family is that of Aerococcaceae (Order Lactobacilli), with a rate of 4.34%, represented by Aerococcus viridans. Other Gram-positive bacilli, with a rate of 13.02% have also been identified. The demonstration of the production of slime by strains on RCA medium revealed that 91.30% of the strains tested produced slime. The TCP method revealed that 65.21% of the isolates have a potential to form biofilms: 34.78% of the strains having shown a visible and strong adhesion capacity on microplates, 30.43% of the strains showed a moderate capacity of adhesion. The results of the TM technique are different from those obtained by the TCP method, it is possible to see that 39.13% and have a high potential for cell adhesion on a glass support. Research on slide adhesion capacity revealed that 73.91% adhere after 3 hours and 91.30% after 24 hours of incubation, and sometimes with microbial slime production. For the determination of the hydrophobicity of the strains All of the strains, with the exception of Raoutella ornithinolytica, exhibited a greater or lesser percentage of hydrophobicity, and more likely to form biofilms. Keywords: Diabetic foot, Infection, Microbiological profile, Biofilm.
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Mémoire master 2 biologie
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