Structures et Propriétés des Carbohydrates Substitués
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Date
2017-01-25
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Abstract
الملخص (بالعربية) :
النيلة الغليكوسسيلاتي هي مركبات مضادة لتكاثر بعض أنواع السرطان. في هذا العمل درسنا خصائص أنواع مختلفة من التطعيم الغليكوسيلي(α, β) في المركبات التالية: الأكاشين أ، -αرامنوز النيلة، β-رامنوز النيلة، α- د غلوكوز النيلة و α-د مانوز النيلة. حسابات كيمياء الكم مع طريقة الكثافة الوظيفية المستقلة عن الوقت (B3LYP/DFT) ومجموعة القواعد 6-31+G(d,p), 6-311+G(2d,p) و cc-Pvdz قد استعملت.قمنا بدراسة البنية ألهيكلية المعايير الهندسية والطاقة الإلكترونية في الوسط الغازي وفي مذيب DMSO . واخترنا نموذج اذابة C-PCM. تم الحصول على التنقلات الكيماوية للبروتونات باستخدام طريقة GIAO في DMSO كمذيب. استعملنا أيضا طريقة TD-DFT لدراسة التنقلات الإلكترونية بين مستويات الطاقة. دراسة مختلف التفاعلات عاى مستوى المركبات تمت عن طرق التحليل NBO. واصفات التفاعلية العامة و المحلية تم حسابها أيضا. الدراسات المنجزة بينت أن لمختلف التطعيمات الغليكوزية تأثير واضح عى خصائص المركبات المدروسة بما فيه النشاط البيولوجي لهده الأخيرة.
الكلمات المفتاحية: النشاط التثبيطي, طريقة DFT, التحليل NBO, النيلة الغليكوسيلاتتي
Résumé (Français et/ou Anglais) :
Abstract
Indigo N-glycosides (blue sugars) are anti-proliferative compounds against several human cancers. In this work we investigate the properties of different types of glycosidic linkages α and β, in Akashine A, α et β-L RAMNO-indigo, α-D-gluco-indigo et α-D-manno-indigo molecules. Quantum chemical calculations with density functional theory (DFT), B3LYP functional and 6-311+G(2d,p), cc-pVDZ as basis sets were used. Structural studies were carried out in gas phase and in DMSO solvent. Gauge including atomic orbitals (GIAO) approach were used to calculate 1H NMR chemical shifts in DMSO as solvent with the conductor polarizable continuum model (CPCM). Also, time dependent density functional theory (TD-DFT) was used to determine the electronic transitions and their nature within the molecules. The activity and the stabilization energy of various intra and intermolecular interactions were determined by NBO analysis. Moreover, the global and local reactivity descriptors were calculated to determine the reactive sites in the all conformers. The study shows that, the different glycosidic linkages have a significant influence on the molecular properties including biological activity
Résumé
Indigo N-glycosilés sont des composés antiprolifératifs contre certains cancers. Dans ce travail, nous étudions les propriétés des différent types de glycosidic greffage (α, β) dans les composés : Akashine A, α et β-L RAMNO-indigo, α-D-gluco-indigo et α-D-manno-indigo. Des calculs de chimie quantique avec la méthode de la densité fonctionnelle indépendante du temps (DFT) la fonctionnelle B3LYP et les bases 6-31+G(d,p), 6-311+G(2d,p) et cc-Pvdz ont été utilisées. Nous avons étudié leurs structures, leurs paramètres géométriques, leurs énergies électroniques dans la phase gazeuse et dans le solvant DMSO avec le model de solvatation CPCM. Les déplacements chimiques des protons ont été obtenus par utilisation de la méthode GIAO dans le DMSO comme solvant. La méthode de la densité fonctionnelle dépendante du temps TD-DFT a été utilisée pour étudié les transitions électroniques entre les niveaux énergétiques. L’activité et l’énergie de stabilisation des différente interactions intra et intermoléculaires ont été déterminées par l’analyse NBO. En plus, les descripteurs globaux et locaux de la réactivité ont été calculés pour déterminer les principaux cites actifs au niveau de tous les molécules. Les études effectuées montrent que les différents types de glycosidic greffage ont des influences significatives sur les propriétés de nos molécules y compris les activités biologiques.
Mots clés : Activité inhibitrice, la méthode DFT, Analyse NBO, Indigo N-glycosilés
Description
Doctorat en Sciences
