Isolement et identification des bactéries antagonistes vis-à-vis des souches pathogènes multirésistantes

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2021-05-04
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Résumé (en Français) : L’émergence sans cesse croissante de bactéries résistantes face à l’appauvrissement des ressources thérapeutiques et à l’absence d’avancée dans le domaine des antibiotiques, mettent en avant l’importance de trouver de nouvelles solutions. Les bactéries lactiques sont depuis des millénaires un moyen de bio conservation efficace de nombreux produits alimentaires. Les 200 bactéries lactiques isolées à partir du lait (chamelle et chèvre) et des produits laitiers fermentés traditionnels (Jben et kamaria) du sud Algérienː Enterococcus, Streptococcus, Lactococcus et Leuconostoc sont identifiées phénotypiquement. La mise en évidence de l’activité antibactérienne vis-à-vis de souches pathogènes multirésistantes, isolées à partir de patients atteints d’infections au service de réanimation est évaluée et les souches résistantes aux antibiotiques sont retenues. Ensuite, les souches lactiques isolées, selectionnées antagonistes Lactococcus raffinolactis LAB9 et Leuconostoc mesenteroides subsp.cremoris LAB13 sont utilisées pour une éventuelle caractérisation de bactériocines. La caractérisation physico-chimique de bactériocines produites chez les souches isolées, sélectionnées antagonistes (LAB9 et LAB13) a révélé leur thermo-résistance, accompagnée d’une activité inhibitrice stable à différentes valeurs de pH. Ensuite, une purification partielle de bactériocine par précipitation avec le sulfate d’ammonium est réalisée et la concentration minimale inhibitrice est déterminée. L'activité antibiofilm souches LAB9 et LAB13 vis-à-vis de la formation de biofilms de Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa est est effectuée. L'étude du suivi de la cinétique de croissance a montré une inhibition considérable de la croissance P. aeruginosa (PA), après l'ajout d'un volume de 1 ml des surnageants des bactéries lactiques isolées, sélectionnnées (LAB9 et LAB13). Cette inhibition est expliquée par l'arrêt du cycle cellulaire de P. aeruginosa PA (une croissance déséquilibrée), en comparaison avec la biomasse non traitée (croissance équilibrée). En conclusion, les résultats obtenus ont montré la nécessité d’approfondir les recherches sur la purification des bactériocines par l'utilisation des techniques modernes telles que HPLC, FPLC, électrophorèse et leur clonage dans des vecteurs d'expressions puissants. Les mots clés : Produits laitiers, bactéries lactiques, bactéries pathogènes , multirésistance, Bactériocine, CMI , CMB, Biofilm. Abstract (en Anglais) : The ever-increasing emergence of bacteria resistant to the depletion of therapeutic resources and the lack of progress in the field of antibiotics, highlights the importance of finding new solutions. Lactic acid bacteria have been an effective means of bio-preservation for many food products for thousands of years. The 200 lactic acid bacteria isolated from milk (camel and goat) and traditional fermented dairy products (Jben and kamaria) from southern Algeria Enterococcus, Streptococcus, Lactococcus and Leuconostoc are phenotypically identified. The demonstration of the antibacterial activity vis-à-vis multiresistant pathogenic strains isolated from patients with infections in the intensive care unit is evaluated and the antibiotic resistant strains are selected. Then, the isolated lactic strains, selected antagonists Lactococcus raffinolactis LAB9 and Leuconostoc mesenteroides subsp.cremoris LAB13 are used for a possible characterization of bacteriocins. The physicochemical characterization of bacteriocins produced in isolated strains, selected antagonists (LAB9 and LAB13) revealed their thermo-resistance, accompanied with a stable inhibitory activity at different pH values. Then, partial purification of bacteriocin by precipitation with ammonium sulfate is carried out and the minimum inhibitory concentration is determined. The antibiofilm activity of the LAB9 and LAB13 strains against the formation of Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa biofilms is carried out. The study of the monitoring of the growth kinetics showed a considerable inhibition of the growth of P. aeruginosa (PA), after the addition of a volume of 1 ml of the supernatants of the isolated, selected lactic bacteria (LAB9 and LAB13). This inhibition is explained by the cell cycle arrestof P. aeruginosa PA (unbalanced growth), in comparison with untreated biomass (balanced growth). In conclusion, the results obtained showed the need for further research on the purification of bacteriocins by the use of modern techniques such as HPLC, FPLC, electrophoresis and their cloning into powerful expression vectors. Keywords : Dairy products, lactic acid bacteria, pathogenic bacteria, multidrug resistance, Bacteriocin, CMI, CMB, Biofilm.
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Doctorat en Sciences
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