- [ VRPG-Doc] Sciences biologiques --- علوم بيولوجية
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- ItemIsolement et caractérisation des rhizobactéries promotrices de la croissance des plantes capables de lutter contre le Fusarium(2017-05-22) LARADJ ZAZOU Khalida; Encadreur: ABBOUNI BouzianeRésumé (Français et/ou Anglais) : L’utilisation de certains microorganismes non pathogènes (Plant Growth Promoting Rhizobactéria, PGPR) en tant que biopesticides est une technologie émergente et écologiquement compatible considérée comme alternative prometteuse aux pesticides de synthèse. L’objectif de ce présent travail est l’isolement d’une large gamme de bacteries rhizosphériques manifestant une activité antifongique vis-à-vis de Fusarium oxysporum f. sp radicis lycopersici et promotrices de la croissance de cultures de la tomate. Le screening primaire effectué à partir de la rhizosphère de tomate, prélevée dans la région de Mehdia (Tunisie), sur un milieu de culture gélosé a permis l’isolement de vingt deux (22) souches bactériennes. Le screening secondaire des souches isolées à partir de la rhizosphère a permis la sélection de quatre souches bactériennes stimulatrices de la croissance de la culture de la tomate in vivo. L’identification phénotypique, moléculaire des quatre souches bactériennes, sélectionnées stimulatrices de la croissance de la tomate in vivo et la caractérisation de leur potentiel PGPR in vitro par l’étude de la production de l’acide salicylique, de l’acide indole acétique, la solubilisation du phosphate, la fixation de l’azote atmosphérique et l’activité antagoniste vis-à-vis de Fusarium oxysporum f. sp radicis lycopersici a été effectué. L’amplification du fragment d’ADN codant la région 16S ARN des quatre souches bactériennes, sélectionnées stimulatrices de la croissance de la tomate in vivo et leur séquençage ont révelé leur appartenance aux espèces suivantes : MR1 : Acidovorax avenae subsp. avenae, ME1 : Pseudomonas putida, MS3 : Microbacterium arthrosphaerae et MR6 : Rahnella aquatilis. Par ailleurs, les quatre souches ont manifesté une activité antagoniste vis-à-vis de Fusarium oxysporum f. sp radicis lycopersici in vivo. L’étude de la résistance systémique des cultures de la tomate, traitée par le Fusarium oxysporum f. sp radicis lycopersici et induite par les quatre souches sélectionnées est basée sur la réduction des symptômes de maladie et l’accumulation d’un composé de type phytoalexine dans les tissus des tomates traitées, analysé par (HPLC). L’inocuation des cultures de la tomate avec les quatres souches sélectionnées a montré une excellente résistance de la tomate vis-à-vis de Fusarium oxysporum f. sp radicis lycopersici, traitées par les deux isolats Acidovorax avenae subsp. avenae et Pseudomonas putida. A cet effet, les bactéries sélectionnées stimulatrices de la croissance pourront substituer l’utilisation courante des engrais chimiques xénobiotiques et nocifs.
- ItemIsolement et caractérisation des souches productrices de lipase.(2015-12-01) LARBI DAOUADJI Kelthoum; Encadreur: ABBOUNI BouzianeRésumé (Français et/ou Anglais) : La demande en thermo-enzymes pour des applications biotechnologiques est de forte croissance. Les lipases sont, parmi les enzymes thermophiles, les plus recherchées dans divers secteurs industriels. Les objectifs de ce travail étaient l’isolement et l’identification des souches thermophiles productrices de la lipase à partir des sources thermales de différentes wilayas d’Algérie, L’optimisation des conditions impliquées dans la production de la lipase par ces souches, leur purification et l’étude des propriétés catalytique de la lipase sont mise en évidence. Le criblage primaire des souches productrices de la lipase sur milieu minimal contenant une concentration de 1% de l’huile d’olive et de tween 80 comme seul source de carbonea permis l’isolement de 59 souches bactériennes thermophiles aérobies. Le criblage secondaire a permis la sélection de 5 souches productrices de la lipase très performantes. L’utilisation des galeries API (20E, 20NE) et l’interprétation probalistique des résultats obtenus a permis l’identification des souches sélectionnées comme étant : GH5 : Geobacillus, S5 : Bacillus subtilis, HB5 : Pseudomonas fluorescens, WO4 : Bacillus licheniformis, HR2 : Bacillus cereus. Différents paramètres impliqués dans la production de lipase et la biomasse tels que la température, la source de carbone et d’azote, la durée d’incubation, la concentration de l’inoculum, la valeur de pH ont été optimisés. Les résultats obtenus ont montré que l’inoculation des souches sélectionnés (WO4, GH5, HB5, HR2, S5) sur milieu de culture minimal, incubées à une température de 50°C pendant un temps d’incubation 72 heures a donné une production maximale (35000, 33000, 2 9000, 26000, 24000µmol/ml/min). La purification partielle de la lipase chez les souches sélectionnées productrices a été effectuée en étapes successives : Dans un premier temps, les protéines sont fractionnées par précipitation au sulfate d’ammonium, ensuite dialysées dans une solution tampon de phosphate de potassium pendant une heure. Dans un second temps, la fraction protéique active est ensuite soumise à une purification partielle sur chromatographie d’échange d’anion (DEAE de cellulose). L’activité enzymatique des lipases produites chez les cinq souches sélectionnées est maximale à des valeurs de pH comprise entre 7-10 et une température de 50-70°C. La purification de la lipase produite chez les souches (S5, HR2, HB5, GH5, WO4) par précipitation au sulfate d’ammonium (40% et 60%) et la chromatographie sur colonne de DEAE-cellulose, a donné les rendements respectifs (19,4, 19,38, 18,1, 17,4, 19,4 %). L’activité enzymatique de la lipase se manifeste stable à des valeurs de pH comprise entre 5-10 et à des températures situées entre 60-90°C pendant un intervalle de temps d’une heure. Par ailleurs, L’activité enzymatique de la lipase est fortement stimulée en présence des ions de Ca+2 et Mg+2 à une concentration de 1mM. Cependant, la présence de certains métaux tels que le Cu+2, Zn+2 et Mn+2 à une concentration de 1mM a manifesté un effet d’inhibition. Mots clés :lipase, criblage, thermophiles, optimisation, caractérisation, stabilité, cinétique de croissance.
- ItemDetermination des principes nutritionnels et fonctionnels de la pulpe du fruit du jujubier . etude de son potentiel antioxydant et antiinflammatoire(2016-05-19) Mansour insaf fatima zohra; Encadreur: BENALI MohammedRésumé (Français et/ou Anglais) : L’objectif de ce travail consiste à évaluer les principes nutritionnels conventionnels de la pulpe du fruit du jujubier (PFJ) écotype "Zfisef" produit dans l’ouest algérien et à déterminer les composés du métabolisme secondaire ainsi que l’activité antioxydante. Cette dernière ainsi que le potentiel anti-inflammatoire sont mis en évidence in vivo. La PFJ montre un taux d’humidité de 19%, un taux de cendre de 6.1%, un taux de protéines de 2,88 %, une teneur en lipides, en sucres totaux et en vitamine C sont respectivement de 0.28%, 23,20% et 0,194%. Les composés du métabolisme secondaires révèlent un taux de polyphénols totaux important au niveau de l’extrait ethanolique de Ziziphus (EEZ) de la PFJ (7.80 ±0.40 mg EAG /g). Les flavonoïdes représentent 25.58±16.6 mg EQ/gr. Quant la fraction des tanins condensés, elle semble plus importante comparée à celle hydrolysable (P<0,05). Le taux d’anthocyanes de la PFJ est de 4,81±0,44 mg équivalent cyanidine 3-glucoside pour 100 g de PFJ tandis que le béta carotène représente 5,02±0,19 mg pour 100g. Le pourcentage d’inhibition par le DPPH est de 56,60±3,99% à la concentration de l’EEZ de PFJ de 0,25±0,062 mg/ml. Le pouvoir réducteur de l'EEZ et celui de l'acide ascorbique sont déterminé par la méthode FRAP et exprimés en densité optique. Il est de 0,533 ± 0,035 et 1,16 ± 0,020 DO à la concentration de 0,1 mg/ml et 1,87 ± 0,044 et 3,22 ± 0,044 à la concentration de 0,5 mg/ml respectivement pour l’EEZ et l’acide ascorbique. Les composés phénoliques identifiés dans la PFJ par LC- MS/MS sont variés et nombreux en comparaison avec ceux des espèces étrangères. L’effet de l’EEZ sur le taux de survie de Saccharomyces cerevisiea a montré qu’à la concentration de 176 mM de peroxyde d’hydrogène sans l’extrait de PFJ la somme des colonies est estimée à 221UFC/ml soit une diminution de 50% correspondant à la DL 50 alors qu’elle atteint le chiffre de 344 (≈78%) soit une augmentation de 28% par rapport au nombre de colonies à la DL50. Notre EEZ a un effet palliatif par son potentiel antioxydant appréciable face à l’effet létal du peroxyde d’hydrogène. L’étude in vivo de l’induction d’œdème par injection de carragénine chez le rat Wistar démontre l’effet anti-œdémateux de l’EEZ comparé au Diclofénac. Dans les mêmes conditions expérimentales, la détermination immunoturbidimétrique du CRPr et l’étude de la formule leucocytaire confirment l’effet anti- inflammatoire de ce fruit. Abstract : The objective of this work is to assess the conventional nutritional principles of the pulp of the fruit of the jujube (PFJ) ecotype "Zfisef" product in western Algeria and identify compounds of secondary metabolism and antioxidant activity. The latter and the anti- inflammatory potential are demonstrated in vivo. The PFJ shows a humidity of 19%, an ash content of 6.1%, a protein content of 2.88%, a lipid content, total sugars and vitamin C are 0.28%, 23, 20% and 0.194% respectively. Secondary metabolism of compounds show a significant rate of total polyphenols in the ethanolic extract of Zizyphus (EEZ) of the PFJ (7.80 ± 0.40 mg EAG / g). Flavonoids are 25.58 ± 16.6 mg EQ/gr. As the fraction of the condensed tannins seems more important compared to that hydrolyzable (P <0.05). The anthocyanin content of the PFJ is 4.81 ± 0.44 mg equivalent cyanidin 3-glucoside per 100 g of PFJ while the beta carotene is 5.02 ± 0.19 mg per 100g. The percent inhibition by DPPH is 56.60 ± 3.99% at the concentration of EEZ PFJ 0.25 ± 0.062 mg/ml. The reducing power of the EEZ and the ascorbic acid are determined by the FRAP method and expressed as optical density. It is of 0.533 ± 0.035 and 1.16 ± 0.020 OD at a concentration of 0.1 mg/ml and 1.87 ± 0.044 and 3.22 ± 0.044 at the concentration of 0.5 mg/ml respectively for the EEZ and ascorbic acid. Phenolic compounds identified in the PFJ by LC-MS/MS are varied and numerous in comparison with those of the foreign species. The effect of EEZ on Saccharomyces cerevisiea survival rate shows that at the concentration of 176 mM hydrogen peroxide, without the extract PFJ, the sum of colonies is estimated 221UFC/ml with 50% reduction corresponding to the LD50, whereas it is 344 CFU/ml (≈78%) a 28% increase relative to the number of colonies to the LD50. Our EEZ has a palliative effect by its appreciable antioxidant potential against the lethal effect of hydrogen peroxide. The in vivo study of the induction of edema by carrageenan injection in Wistar rats demonstrates the anti- edematous effect of EEZ compared to Diclofenac. In the same experimental conditions, the determination of Immunoturbidimetric CRPr and the study of leukocyte count confirms the anti-inflammatory effect of this fruit.
- ItemFacteurs de risque de l’infertilité féminine dans l’ouest de l’Algérie (Région d’Oran et Sidi Bel Abbes)(2016-06-02) MAÏ Abdessalem Hichem; Encadreur: DEMMOUCHE AbbassiaRésumé (Français et/ou Anglais) : Introduction : Selon l'organisation mondiale de la santél’infertilité féminine est un problème croissant dans pratiquement toutes les cultures et sociétés. Partout à travers le monde, le nombre de couples infertiles est estimé à 48,5 millions, l'infertilité est donc un problème de santé mondial qui doit être abordé, en particulier dans les pays en voie de développement où les taux d'infertilité sont plus élevés. L’objectif de cette recherche est d'étudier les différentes causes et facteurs de risque de l'infertilité chez les femmes en âge de procréer dans deux régions différentes d’Algérie (Oran et Sidi Bel Abbes), afin de récolter plus d'informations sur le problème d'infertilité en Algérie. Méthodes : Nous avons réalisé une étude de type transversal descriptif s’intéressant aux facteurs de l’infertilité de façon générale dans la région d’Oran et Sidi Bel Abbes. Nous avons ensuite entamé une 2éme étude du même type qui s’est particulièrement penchée sur les facteurs de risque de l’infertilité secondaire. Deux études rétrospectives ont été réalisées afin d’analyser l’impact des fibromes utérins et infections génitales sur la fertilité des femmes atteintes de ces pathologies. Une étude Cas-Témoin a été faite afin d’évaluer l’association de l’indice de masse corporelle avec la fertilité féminine. Enfin une étude observationnelle a été effectuée dans le but de déterminer le profil hormonal des femmes souffrant d’infertilité. Résultats : Les résultats de la 1ère étude ont montré que les causes d’infertilité les plus fréquentes sont les infections génitales (13.49%), les problèmes dans les trompes de Fallope (12.69%) et le déficit ovarien (9.52%), un grand pourcentage de patientes avaient une infertilité d’origine inexpliquée (30.95%). La deuxième étudea indiqué que (34.3%) des femmes souffrant d’infertilité secondaire avaient déjà eu un avortement et la cause d’infertilité la plus représentée était l’infection génitale (16.3%). L’étude des fibromes nous a permis de constater que ce sont les fibromes sous-muqueux (Odd Ratio=1.36) et intra-muros (Odd Ratio=3.02) qui sont les plus associés à l’infertilité, alors que l’infection génitale la plus fréquente chez les patientes infertiles était Chalamydia Trachomatis (47.5%). L’étude portant sur les indices de masse corporelle chez les femmes fertiles et infertiles a montré que les patientes obèses et en surpoids avaient 2 à 3 fois plus de risque de souffrir de l’infertilité (Odd Ratio =2.23 et 3.26). Finalement l’analyse des profils hormonaux a indiqué que les problèmes chez les femmes infertiles se trouvaient principalement au niveau de la prolactine (17.5%), de l’hormone lutéinisante (25.1%) et de l’hormone folliculostimulante (25 %). Conclusion : Cette étude offre un premier aperçu des différents facteurs de risque de l'infertilité féminine à Sidi Bel Abbes et à Oran. Les résultats retrouvés concordent avec ceux de la littérature, mais d’autres recherches sont nécessaires pour évaluer de façon plus précise chacun des facteurs étudiés et inclure d’autres paramètres qui n’ont pas été abordés dans cette thèse. Mot clés : Infertilité féminine- Facteurs de risque -Sidi Bel Abbes-Oran Résumé (Français et/ou Anglais) : Introduction: According to the World Health organization infertility is a growing health problem in virtually all cultures and societies around the world and the number of infertile couples is estimated to be 48.5 million worldwide, showing that infertility is a global health problem that must be addressed, especially in developing countries where infertility rate are shown to be higher.The goal of this research was to study the various causes and risk factors of infertility in women of reproductive age in two different regions of Algeria (Oran and Sidi Bel Abbes), in order to have more information on the infertility problem in Algeria. Methods: We performed a descriptive, cross-sectional study focusing on the factors of infertility in the region of Oran and Sidi Bel Abbes, we then did a second similar study that was particularly focused on the risk factors of secondary infertility. Two retrospective studies were carried out to analyze the impact of uterine fibroids and genital infection on fertility of women. A Case-Control study was made to assess the association of body mass index with female fertility. Finally an observational study was conducted to determine the hormonal profile of women suffering from infertility. Results: The results of the first study showed that the most common causes of infertility are genital infections (13.49%), problems in the fallopian tubes (12.69%) and ovarian failure (9.52%), a large percentage of patients had unexplained infertility (30.95%). The second study indicated that (34.3%) of women with secondary infertility had already had an abortion and the most found cause of infertility was genital infection (16.3%). The study of fibroids allowed us to see that it is the submucosal fibroids (Odd Ration = 1.36) and intramural (Odd Ratio = 3.02) that are most associated with infertility, while the genital infection most common in infertile patients was Chalamydia trachomatis (47.5%). The study of body mass index in fertile and infertile women showed that overweight and obese patients were 2-3 times more likely to suffer from infertility (Odd Ratio = 2.23 and 3.26). Finally the analysis of hormonal profiles indicated that problems in infertile women were mainly found in prolactin (17.5%), luteinizing hormone (25.1%) and follicle stimulating hormone (25%). Conclusion: This study provides the first glimpse at the different risk factors of female infertility in Oran and Sidi Bel Abbes. results are in accordance with those of the literature, but more research are needed to assess more accurately each factors studied and include other parameters that have not been addressed in this thesis. Key words: Female Infertility- Risks factors -Sidi Bel Abbes-Oran
- ItemEffets des vitamines (C, E), du NADH et des acides gras sur la prolifération lymphocytaire, la sécrétion des cytokines et le statut redox chez les patients atteints de maladies métaboliques.(2017-05-15) MERAOU Asmaa; Encadreur: MERZOUK Hafida; Co-Encadreur: BELBRAOUT SlimaneRésumé (Français et/ou Anglais) : Résumé Le Diabète de type 1 et 2, l’hypertension, et l’obésité sont associés à de nombreuses complications notamment un dysfonctionnement du système immunitaire et un stress oxydatif. Les objectifs de ce travail de doctorat sont de déterminer les conséquences métaboliques de ces pathologies et les effets in vitro de certaines vitamines (C, E) du NADH et de certains acides gras présents dans les huiles (huile d’olive, lin, nigelle et tournesol) sur la prolifération lymphocytaire, la sécrétion des cytokines et le statut redox intracellulaire. Des prélèvements sanguins sont réalisés chez 138 patients de sexe masculin dont 26 diabétiques de type 1, 15 diabétiques de type 2, 15 hypertendus, 32 obèses et 50 hommes témoins. Ces échantillons sont utilisés pour les dosages des paramètres biochimiques (glucose, urée, créatinine, triglycérides, cholestérol), et des marqueurs du statut oxydant/antioxydant (enzymecatalase, glutathion, MDA, protéines carbonylées). Les lymphocytes T sont isolés à partir du sang par centrifugation sur gradient de densité de l’histopaque, puis incubés en présence d’un agent mitogène (la Concanavaline A), des vitamines, un coenzyme et des acides gras pendant 48 heures à 37°C et 5% CO2, et sont par la suite utilisées pour analyser la prolifération, les cytokines et le statut redox intracellulaire. Notre travail révèle l’existence de perturbations du métabolisme glucidique et lipidique associées à un déséquilibre de la balance oxydante/antioxydante chez les hommes diabétiques, hypertendus et obèses. De plus, les effets immuno-stimulateurs des vitamines C, E et du NADH sur la prolifération et la fonction lymphocytaire, en plus de la restauration du statut redox sont mis en évidence aussi bien au cours du diabète que de l’hypertension et l’obésité. Nos résultats montrent aussi que les huiles ont des effets modulateurs différents selon le type de pathologies étudiées, associés à un effet antioxydant et anti-inflammatoire notamment en présence de l’huile de lin , de nigelle et d’olive. En conclusion, la supplémentation en vitamines, en NADH et en acides gras peut être bénéfique avec des effets positifs sur la fonction lymphocytaire et le stress oxydatif au cours des maladies métaboliques. Mots-clés : Diabète sucré, Hypertension, Obésité, Vitamines (C, E), NADH, Huile de lin, Huile de nigelle, Huile d’olive, Huile de tournesol, Lymphocytes, Cytokines, Statut redox.
